PhpMyAdmin incluye opciones para relacionar tablas (de tipo InnoDB), pero muchas veces vienen desactivadas y al darle al boton operaciones en la base de datos, aparece el error: Las opciones adicionales para trabajar con tablas vinculadas fueron desactivadas. Para saber porqué, dé clic aquí.

Para activarlas debemos añadir algunas opciones a los ficheros de configuración del PMA.

En algunos paquetes que integran Apache, MySQL y PHP no es necesario configurar nada porque ya traen activadas por defecto estas opciones, como XAMPP. En otros paquetes, aunque configures estas opciones, es posible que sigan sin funcionar las relaciones, como en el WAMP.

Para lograr que funcionen las relaciones debemos seguir estos pasos:
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